На Балтийском флоте с 2009 года реализуется целевая программа Министерства обороны РФ по обеспечению социальных гарантий и обеспечению профессиональной переподготовки увольняемых военнослужащих.

Как сообщила группа информационного обеспечения Балтийского флота, для военнослужащих, проходящих службу в воинских частях, дислоцирующихся на территории Калининградской области, профессиональная переподготовка проходит на базе Балтийского военно-морского института имени адмирала Ф.Ф. Ушакова, для военнослужащих Ленинградской военно-морской базы - на базе петербургских военно-учебных заведений (Военно-космической академии имени А.Ф. Можайского, Военной академии связи имени С.М. Будённого, Военного инженерно-технического университета).
Органами воспитательной работы и отделом кадров Балтийского флота организовано нормативно-правовое, методическое и информационное обеспечение увольняемых военнослужащих. Специалистами кадрового органа проводится работа по профориентации и подбору гражданской специальности с учётом имеющихся у военнослужащего квалификации, опыта и личных качеств.
Обучение проводится по следующим направлениям: «использование, техническое и программное обеспечение ПЭВМ» и «английский язык в профессиональном общении» (Балтийский военно-морской институт имени Ф.Ф. Ушакова), «защита информации в вычислительных системах и сетях» и «проверка средств измерений (неэлектрических, электронных величин)» (Военно-космическая академия имени А.Ф. Можайского), «многоканальные телекоммуникационные системы» (Военная академия связи имени С.М. Будённого), «городское строительство и хозяйство», «энергообеспечение предприятий», «энергетические системы сети» (Военный инженерно-технический университет).
В 2009 году по целевой программе Министерства обороны РФ профессиональное переобучение прошли более 60 военнослужащих, в 2010 году - более 70. Выпускники курсов получают дипломы государственного образца, которые удостоверяют их право на ведение профессиональной деятельности в выбранной сфере.
Помимо договорённостей с военными вузами, командование Балтийского флота организовало взаимодействие с правительством Калининградской области и руководством областного агентства по обеспечению занятости населения с целью профессиональной переподготовки увольняемых военнослужащих. В 2009-2010 годах на базе регионального Центра переподготовки и трудоустройства военнослужащих получили дипломы по специальностям «менеджмент» и «управление персоналом и организацией» 307 человек.
Кроме того, по договорённости с Калининградским государственным техническим университетом (КГТУ) 23 военнослужащих прошли переподготовку по специальности «охрана труда».
В 2011 году на Балтийском флоте продолжается реализация программы профессионального переобучения увольняемых военнослужащих. С 1 февраля в Калининграде были набраны очередные группы на переобучение на базе БВМИ, также готовятся группы для обучения в КГТУ и в региональном Центре переподготовки и трудоустройства военнослужащих.
Результаты исследований по реализации полученных военнослужащими знаний в последующей гражданской деятельности, проведённых отделом кадров Балтийского флота, показали, что полученные навыки на новой работе оказались необходимыми более чем половине прошедших переподготовку военнослужащих.